Tím výskumníkov pod vedením Dr. Ling-Hua Wanga z University of Texas MD Anderson Cancer Center nedávno publikoval novú štúdiu v Nature Medicine, ktorá podrobne popisuje rôzne stavy T buniek v nádoroch, čím poskytuje nové poznatky pre pochopenie vývoja nádoru a jeho zlepšenie. účinnosť nádorovej imunoterapie.
Nádor infiltrujúce T bunky sú kľúčovými hráčmi pri zabezpečovaní účinku imunoterapie a ich funkčný stav je tiež úzko spojený s nepriaznivými účinkami imunoterapie. Komplexné pochopenie funkčného stavu T-buniek je nevyhnutné pre pokrok vo vývoji nových terapií a prospech pre viac pacientov.
Na tento účel výskumný tím vykonal podrobný „sčítanie“ T buniek infiltrujúcich nádor integráciou súborov údajov a analýzy rakoviny, čo viedlo k doteraz najpodrobnejšiemu atlasu heterogenity T buniek infiltrujúcich nádory s vysokým rozlíšením. Atlas integruje 27 súborov údajov o sekvenovaní jednobunkovej RNA, ktoré pokrývajú 16 typov rakoviny a viac ako 300 000 T buniek s údajmi o transkriptóme jednej bunky.
Celkovo nový pan-rakovinový jednobunkový T-bunkový atlas identifikoval 32 rôznych subpopulácií T-buniek a určil relatívne proporcie každého fenotypového stavu. Tieto zahŕňajú sedem rôznych transkripčných stavov v subpopulácii CD4 plus regulačných T buniek, päť transkripčných stavov v subpopulácii CD4 plus folikulárnych pomocných T buniek a osem transkripčných stavov v proliferatívnej subpopulácii T buniek.
Výskumníci identifikovali jedinečnú T bunku v stave stresovej odozvy, ktorú nazvali TSTR, charakterizovanú vysokou expresiou génov tepelného šoku, na rozdiel od akejkoľvek inej subpopulácie CD4 plus alebo CD8 plus T buniek. Zdá sa, že tieto T bunky v stave reakcie na stres sú „vystresované“ a rovnako ako sa ľudia stávajú menej produktívnymi, keď sú v strese, tieto vystresované T bunky sú menej účinné v boji proti rakovine.
▲Mapovanie s vysokým rozlíšením ukazuje rôzne stavy T buniek v mikroprostredí nádoru a T bunky v stave reagujúcim na stres sú označené bielymi bodkami (zdroj obrázka: Odkaz [2])
Takto stresované T bunky môžu byť prítomné v mikroprostredí nádoru pri všetkých typoch rakoviny, najmä pri nádoroch, ktoré nereagujú na imunoterapiu. Predpokladá sa, že zlyhanie imunity nádoru môže súvisieť s touto skupinou nadmerne zaťažených T buniek „rakovinovým stresom“.
Vieme, že vyčerpaná trieda T-buniek v mikroprostredí nádoru je tiež spojená s ťažkosťami pri imunoterapii, ale vedci starostlivo analyzovali dráhu diferenciácie TSTR, ktorá nie je rovnaká ako predtým známy stav vyčerpania T-buniek, čo znamená, že môže existovať nová cesta vedúca k dysfunkcii T buniek. Vedci poznamenali, že sa očakáva, že následné štúdie mechanizmov toho, ako sú T bunky indukované v stresovom stave v mikroprostredí nádoru, a ako blokovať alebo zvrátiť stres T buniek, vyvinú nové terapie a zlepšia účinnosť imunoterapie.
Výskumný tím tiež vyvinul TCellMap, automatizovaný anotačný program T buniek a interaktívny portál pre používateľov, ktorí môžu vyhľadávať tento atlas T buniek, aby viac výskumníkov mohlo vykonať hĺbkovú analýzu T buniek a nakoniec objaviť nové terapie na zlepšenie T buniek. prospech pacientov.
Referencie:
[1] Yanshuo Chu et al., (2023) Pan-cancer T bunkový atlas spája stav bunkovej stresovej reakcie s rezistenciou na imunoterapiu.Prírodná medicínaDoi: https://doi.org/10.1038/s41591-023-02371-r
[2] Pan-cancer T bunkový atlas odhaľuje nové podrobnosti o mikroprostredí nádoru. Získané 30. mája 2023 z https://www.eurekalert.org/news-releases/990665